為了替將來的決戰做準備，魔王雷歐尼斯進行了自我封印。但在過了千年之後，不知為何他醒來後卻變成了少年的模樣！接受了所屬於聖劍學園的黎榭莉亞庇護的雷歐尼斯在對於各種陌生的新事物都感到困惑的狀況下進入了聖劍學院就讀－在魔術已經失傳的未來世界，最強魔王與美少女們交織而成的聖劍魔劍學園刀劍奇幻故事就此開幕！！