這是個冠上船艦名稱的少女們所生活的世界，而且與「現在」的世界有點不同。她們隸屬於由許多勢力同心協力組成的聯合組織「碧藍航線」。船艦們都在設置於母港裡的「學園」一起生活。主角標槍、綾波、Z23與拉菲，在這裡與不同陣營的船艦們一起生活。每個陣營的每個船艦，個性都不太一樣、身材也都不太一樣，而且都很獨特，她們在「碧藍航線」會編織出什麼樣的故事呢？