以P4視點描繪的『女神異聞錄Q』八十神高中文化祭的最後一天，P4成員們迷失在了異世界。第一座迷宮「不可思議國度的你」最深處，當眾人身陷危機時，挺身而出的是與自己等人相同，迷失在這異世界的月光館學園的學生們。為了尋找回到原來世界的線索，一行人決定互相幫助探索迷宮…。第四迷宮「稻羽鄉土展」深處，眾人遇見一名長得和玲一模一樣的少女。不僅如此，學校內的鐘塔更是變成了散發不祥氣息的機械高塔……！究竟一行人是否能跨越難關，回到原本的世界？