透過女神異聞錄3視點所描繪的『女神異聞錄Q』的物語——月光館學園”
特別課外活動部”的責任，是討伐怪物陰影以及探索陰影的巢穴『塔耳塔羅斯』。在月光館學園遭遇颱風導致文化祭中止的晚上，眾人一如往常地來到了塔耳塔羅斯，可是卻響起了從未聽過的鐘聲。下一個瞬間，承載著眾人的電梯突然落下，開門後看到的，居然是未曾見過的高中文化祭會場。