為了尋找遺失的「容器」，神秘組織「殼」開始展開行動。這時，慕留人與鳴人正在舉行實戰練習，但鳴人的右手卻使用了科學忍具……慕留人感到很憤慨，這時鳴人又派了新的任務給他！災厄再次降臨！