洛伊德．賽雷斯塔，神秘組織「生命之樹」的一名小雜兵。奉組織之命，洛伊德跟隨隊伍調查「伊甸（Eden）」──那是擁有神一般的力量，比惡夢更恐怖的存在。調查過程中，在組織一向遭人忽視，無望出人頭地的洛伊德，意外結識了兩個獨特的女子。
一女名叫奈亞，據稱是被伊甸毀滅的阿卡維拉星系的唯一生還者。一女名叫娜伊娜，雖然是隻小蘿莉，卻擁有徒手撕裂伊甸，可以用「做夢」來形容的超級力量。
洛伊德與她們結識後，被組織授命跟隨她們。從此，洛伊德的命運走上了無法掌控的窘境。一介小兵的他，不但必須面對輕易摧毀宇宙軍團的伊甸、連伊甸也能徒手殺死的超級蘿莉，以及滿身謎團的美女艦長，接著更遭遇智慧生命的天敵，被稱為「支配者」的宇宙怪獸……
無窮宇宙，最深邃、最神秘的事物一件件出現在洛伊德面前。洛伊德腦袋裡的螺絲還沒擰緊，就隨著越發失控的命運，咕嚕咕嚕地滾到了不知什麼地方。
